سید محمد طاهر در 25 آذر 1338 شمسی مطابق با 7 ربیع الاول 1379 هـ . ق در خانواده ای روحانی و اهل علم در شهر مقدس نجف اشرف در کشور عراق دیده به جهان گشود.( تیپ مستقل83 ...، مروری بر...؛ شکوفه های ...، ص 57) پدرش حضرت آیه الله سید حبیب اله طاهری گرگانی(درگذست: 1368) و مادرش وجیهه علوی حسینی( درگذشت: 1401) صبیه حضرت آیه اله سید سجاد علوی مفسّر قرآن کریم بود( تیپ مستقل 83...، مروری بر ...). سید محمد طاهر سومین فرزند خانواده بود( همان). پس از سپری کردن دوران کودکی تحصیلات ابتدایی را در 1345 در دبستان ایرانیان مقیم نجف آغاز کرد.(همان) و تا سوم ابتدایی درس خواند. سپس به مدرسه علمیه جعفری رفت و زیر نظر پدرش به فراگیری علوم دینی پرداخت( همان؛ زندگینامه و...، نوید شاهد). در سال ۱۳۵۰ ش همراه خانواده‌اش برای اقامت دائم در ایران به گرگان بازگشت. در تابستان همان سال همراه پدرش به سوریه و لبنان مسافرت کرد و با رهبران گروه‌های شیعی لبنان ملاقات نمود. وی در ۱۳۵۲ش در ۱۴ سالگی برای فراگیری علوم دینی وارد مدرسه علمیه امام صادق(ع) گرگان شد و همزمان بطور متفرقه به تحصیلات کلاسیک ادامه و در خرداد ۱۳۵۴ موفق به اخذ دیپلم گردید (اداره آموزش و پرورش گرگان)....